肾肝细胞肝癌是世界十大罕见的肝癌症之一，其中的75%为肾透明肝细胞肝癌（clear cell renal cell carcinoma，ccRCC）并守住了肾肝细胞肝癌丧命的绝大部分。为了阐明ccRCC起因的分子可选择性，TCGA对真核生物、表征DNA组蛋白三组、特异性三组来进行分析法则，认定显现出包括多种畏肝癌DNA缺少在内的ccRCC分子可构造。分析推测VHLDNA异常是一个一般性都是在流血事件，随后PBRM1、SETD2、KDM5C、BAP1等组蛋白作准备的真核生物转变加剧疾病十分困难，并与摧残性遗传系统性。这些分析指显现出除了活体分析报告另有，可以透过分子可构造对ccRCC病征来进行档次分析，同时认定显现出ccRCC起因的特有真核生物构造。过去指出，ccRCC对现代的化疗和皮肤癌具有抵抗畏止作用，手术开刀是渐进的主要病人策略。近十年，真核生物分析法则认定显现出一些肝细胞途径途径，而且FDA批准了系统性本品，但ccRCC病征对这些本品的反应非常更少。这上会转化过程非常复杂，真核生物、表征DNA组蛋白三组、特异性三组的单独分析法则可能不足以均盘地认定显现出肝癌症的类型以确定有效的病人法则，我们须要开发新的立体化性分析法则策略。2019年10月31日，来自约翰霍普金斯大学的Hui Zhang和Daniel W. Chan、密歇根大学的Marcin Cieslik和Alexey I. Nesvizhskii 、西奈山伊坎法学院的Pei Wang和临床肝细胞内质三组分析法则理事会（Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium）合作关系在Cell时尚杂志上转载Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma，通过对未病人的ccRCC和配对的肝癌旁正常三其组织样品来进行真核生物、表征DNA组蛋白三组、特异性三组、肝细胞内质三组、一锌氮肝细胞内质三组学的立体化性分析法则，推测真核生物分析法则认定显现出一个与真核生物地球磁场系统性的独特分子可亚群；肝细胞内质-真核生物学立体化性分析法则认定显现出由真核生物偏离所加剧的肝细胞内质失调，其中的包括作准备锌一锌氮激素、肝细胞内质译成过程和一锌氮接收机调节等的肝细胞内；对中的病原体肝细胞增生以往来进行分析法则，描摹了四种以有所不同肝细胞途径为构造的病原体性ccRCC亚型。分析共查阅110个未病人的RCC样品及84个相配对的肝癌旁正常三其组织（NAT）样品，对同一个样品来进行真核生物、特异性三组和肝细胞内三组学分析法则。肝细胞内三组和一锌氮肝细胞内三组学分析法则分别认定显现出11355种肝细胞内和42899种葡萄糖肽，其中的7150种肝细胞内和20976种葡萄糖肽在所有样品都得到验证。为了必需多重数据的立体化分析法则，对110个样品来进行均真核生物DNA、均核糖体DNA和总RNADNA，其中的107个来进行DNA组蛋白分析法则，同时75个NAT样品来进行总RNADNA。经过活体分析报告和分子可构造分析法则后，103则有ccRCC和80则有NAT样品的数据用作后续分析法则。ccRCC的真核生物学分析法则推测碱基低度的转变有：碱基3p的臂低度缺少（93%），碱基5q的缩减（54%）、碱基14q的缺少（42%）、碱基7的缩减（34%）、碱基9的缺少（21%）。其中的，14个ccRCC样品中的推测显现出广泛的拷贝数突变（CNVs），坚称真核生物的倾斜度地球磁场。而且档次极低的推测显现出倾斜度的真核生物地球磁场，这与真核生物非整倍体和病因不良有关的引述保持一致。61%的ccRCC推测显现出一种或多种反之亦然流血事件，主要起因在碱基3q核糖体和5号碱基（20%）、2号（11%）和8号（7%）等。新型碱基重排t（3：2），即3p缺少和2q缩减，与t（3：5）重排相互排斥；碱基盘上同时加剧3q的缩减和3p缺少。总之，102则有ccRCC样品中的都推测显现出3p核糖体的失调。体肝细胞组蛋白的分析法则结果推测，85%的ccRCC中的依赖于VHL的失调，是最罕见的组蛋白；PBRM1、BAP1、KDM5C、SETD2的组蛋白比则有分别为43%、17%、18%、16%，而且DNA组蛋白和DNA组蛋白分析法则推测真核生物的失活加剧mRNA和肝细胞内的减少。对组蛋白CpG火山岛的组蛋白来进行分析法则，根据以前引述的CpG火山岛组蛋白遗传标志物（CIMP）来进行分类，36则有CIMP+推测显现出档次极低、过渡阶段更晚、真核生物地球磁场极低等构造。真核生物转变并不需要通过环己烷畏止作用严重影响同核糖体的mRNA和肝细胞内质原子量，通过异构体畏止作用严重影响其他核糖体。对mRNA、肝细胞内质和葡萄糖肽的立体化分析法则，认定显现出对特异性低度、译成低度和译成后低度都有严重影响的真核生物转变，并认定显现出与档次系统性、肝癌与非肝癌三其组织除此以另有差异理解的DNA途径。则有如，与PI3K-mTOR接收机系统性的SQSTM1、OSBPL3、GOLPH3显现出现拷贝数突变（异构体畏止作用）；多能特异性遗传物质YY1（异构体畏止作用）起因组蛋白。对这些真核生物转变来进行途径分析法则，推测碱基3p的缺少加剧低氧接收机、肝细胞内调节和葡萄糖化的升至，锌一锌氮、不饱和脂肪酸激素和TCA反转的大幅提低有关；5q的缩减加剧mTORC1和MYC接收机的升至，7p的缩减加剧肝细胞内译成和黏膜除此以另有充质转移接收机的升至；9p缺少加剧畏止遗传物质CDKN2A缺少，与译成都是在、m TOR、MYC接收机升至有关；14q缺少加剧WNT接收机理解大幅提低，MYC接收机、N-脂类修饰、IFN- γ接收机升至。其中的75%的CIMP+依赖于14q缺少，而且CIMP+推测显现出MYC接收机、肝细胞内译成升至的环己烷畏止作用，并与锌一锌氮（OXPHOS）升至和渐进蜂窝减少有系统性性。分析法则ccRCC肝癌三其组织和非肝癌三其组织的肝细胞内理解差异，推断显现出ccRCC中的565个肝细胞内大幅提低，255个肝细胞内升至，其中的病原体系统、EMT、低氧、葡萄糖化和mTOR接收机在中的升至，TCA反转、不饱和脂肪酸激素和OXPHOS途径大幅提低。葡萄糖化都能的肝细胞内和m RNA 的升至具有耦合性；而OXPHOS只有肝细胞内被大幅提低，其mRNA没有转变，指显现出OXPHOS的调节起因在译成低度。通过葡萄糖肽的原子量分析法则，认定显现出CDK1、MAPK1（ERK2）是大多数中的2个前三名最低的葡萄糖-反应物流血事件。与S期进入/十分困难（CDK7-MCM2）和G2/M检查点（WEE1-CDK1）系统性的一锌氮反应物在大多数中的升低；几乎所有的都升至EGFR（MAPK的干流介导）的肝细胞内和葡萄糖肽理解，而对VEGF介导如FLT和KDR则选择性理解。纵向分析法则所有样品中的葡萄糖肽原子量差异，认定显现出几种葡萄糖肽共理解互联，包括肝细胞内和肺部转化两个不也就是说整体肝细胞内质三组和特异性三组转变的模块。基于病原体分三组的一般构造，并混合特异性三组学、肝细胞内质三组学的构造，并不需要对ccRCC来进行分型：1）CD8+炎性；2）CD8-炎性；3）VEGF病原体缺失；4）激素性病原体缺失。则有如，CD8+炎性展现CD8+ T肝细胞增生以往低，病原体逃避标记物PD1、PD-L1、PD-L2、CTLA4等DNA理解升至，14号碱基缺少kHz较差等构造；CD8-炎性展现天然病原体系统的构造，DC和巨噬肝细胞都是，病原体系统和心肌级联肝细胞内理解缩减等构造。档次是ccRCC的重要病因指标，通常和过渡阶段、微小有关。低档次中的，作准备译成、mTOR接收机、EMT等途径的DNA在mRNA和肝细胞内低度均升至，其他肝细胞途径则在特异性三组和肝细胞内三组显现出现非协同性升至，如肝细胞内调节和DNA修复的mRNA缩减，而OXPHOS和N-脂类修饰的肝细胞内缩减。低档次的展现显现出显现出介导激酶、RAS、MAPK、Notch、RAP1接收机途径等在mRNA和肝细胞内的缩减，同时升至特异性系统性过程的肝细胞内理解。根据的肝细胞内三组差异将ccRCC分为3三组：ccRCC2低理解天然病原体和血小板容颗粒系统性的肝细胞内，ccRCC3升至葡萄糖化、mTOR接收机、低氧系统性的肝细胞内，ccRCC2和ccRCC3和较差的档次系统性，仅ccRCC2与最初系统性；ccRCC1升至生存能力病原体、N-脂类修饰、OXPHOS和不饱和脂肪酸激素系统性肝细胞内，与低档次和晚期有关。总的来说，分析引述了透过真核生物、表征DNA组蛋白三组、特异性三组、肝细胞内质三组、一锌氮肝细胞内质三组学等多种程序来对ccRCC来进行大规模肝细胞内-真核生物学分析法则，解释了真核生物偏离对功能的严重影响，为从分子可病理学角度必要选择病人解决方案缺少了依据。值得注意显现出处：Did J. Clark, Sarana M. Dhanasekaran, Francesca Petralia, et al.Integrated Proteogenomic Characterization of Clear Cell Renal Cell Carcinoma.Cell, Vol. 179, Issue 4, p964?83.e31Published in issue: October 31, 2019
