Cell | 建立人类文明树突状细胞与辅助性T细胞相互作用模型

线粒体-线粒体电磁力异常复杂，仅限于大量底物与讯号通路，教育界钻研多年，仍旧是管里窥豹。来自法国巴黎PSL研究工作大学的Vassili Soumelis一个团队于在Cell周报上发表题为A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的文章，建立联系了试验里与方法论独创的研究工作法则，试验里上，在蛋白质水平检验了线粒体所腺体的线粒体因子与应激反应；方法论上，建立联系了讯号输入输借助于里间的关联和电磁力的关系。所写以本能树突状线粒体（Dendritic cell，亦称DC）与；也T线粒体（T Helper cell，亦称Th）里间的电磁力为研究工作对象，分析方法了36例DC涉及的讯号底物和17种Th腺体的线粒体因子，并依靠这些数据资料建立联系数学框架，演算借助于56种已经被试验里确认的线粒体相互的关系，与此同时，还表明借助于290种可能的关系，并确认了IL-12p70可以通过IL-1讯号通路其会17改型；也T线粒体（亦称Th17）。首先，所写捕获了本能单核线粒体可能的DC（MoDCs）和向外血明末清初CD11c+DC（bDCs）两类线粒体，并抑制24小时。所运用于的抑制讯号主要包含三大类共14种。第一种：内源讯号底物，最主要介导beta（interferon β，亦称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样酶的半胱氨酸，最主要Toll4酶的拮抗剂脂多糖（ lipopolysaccharide，亦称LPS），Toll1/2酶拮抗剂PAM3CSK4，Dectin1拮抗剂Curdlan，Toll2/Dectin1拮抗剂 zymosan，Toll7/8酶拮抗剂R848，Toll3酶拮抗剂 poly(I：C) 和NLRP3炎症小体活化剂铝钾；第三种：细菌病毒，最主要受热灭活的Candida albicans （亦称HKCA），李斯特菌（Listeria monocytogenes，亦称HKLM），Staphylococcus aureus （亦称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （亦称HKSP）和流感病毒（influenza virus，亦称flu）。接下来，所写通过流式线粒体术等法则，检验了36种DC涉及底物的解读原因，其里，29种正处于线粒体表面，7种正处于线粒体腺体上明末清初之里。最近，除了一些已知的DC线粒体鼓动值得注意，所写还有了一些取而代之注意到：（1）zymosan抑制的MoDCs 解读高层次的CD54 和PVR；（2）流感病毒抑制的MoDCs可以其会ICOSL；（3）LPS抑制的MoDCs 可以其会高层次的CD30L和CD83。再下来，所写将这些抑制过的DC与T线粒体研究工作生院6天，随后检验Th的游离效率以及17种Th涉及线粒体因子的解读腺体原因。有趣的是，所写将Th和DC的平庸相互不够为，注意到，这二者里间相当普遍存在具体来说的的关系，也就是说，两种抑制物对DC产生的效果类似，但是，这两种抑制物所解决问题的DC与T线粒体研究工作生院以后，产生的效果很可以相异。接着，所写运用于生物反馈学的法则，以上述试验里数据资料建立联系框架。简单来说，所写综合DC输借助于的36种讯号底物和Th输借助于的17种效应底物，将两两里间的的关系简化为“诱导基因解读”和“但球队向基因解读”两种，并且，还自组数据资料库和已发表文献里的反馈，建立联系了复杂的讯号基因解读局域网。例如，通过这一框架，所写注意到， IL-10的但球队向基因解读底物最主要OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而诱导基因解读底物最主要Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给予DC不同的抑制讯号，所写就可以推断借助于Th鼓动线粒体IL-10的解读腺体原因。最后，所写利用这样框架，试图表明并确认取而代之线粒体相互的关系。通过建立联系的框架，所写注意到，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2都由腺体时，趋向于于基因解读IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 都由借助于现时，则不够趋向于于基因解读IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的解读水平都显着降低。这些结果说明，IL-12参与Th17的其会分化。为了进一步反思IL-12其会Th17的机制，所写运用于活体其会Th的框架，注意到，IL-12相当能直接其会Th17，但是，同时自组IL-1和IL-12，Th17就其会借助于来了。这是一篇试验里与方法论独创的成名作。试验里结果与计算出来利用计算出来机相互支持，相互指导，相辅相成。如下图示意图，试验里之外运用于了密切关联两之外数据资料，一是何种抑制下DC线粒体的鼓动，二是鼓动后的DC对T线粒体的作用。方法论之外以DC和T线粒体的输借助于线粒体因子为核心，建立联系了线粒体因子里间的诱导和但球队向基因解读局域网框架。通过这一框架，所写相符合一些取而代之线粒体间相互的关系，最终再用试验里确认这些的关系是否属实。这篇文章的亮点有交接处，一是建立联系和试验里方法论独创研究工作的除此以外，二是文章里透过的诸多线粒体基因解读反馈以供研究工作参考。原始借助于处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.